Онега, как и Ладога, в сентябре штуки не предсказуемые. Могут отменить Медвежьегорск запросто, как и Валаам в прочем.
К тому же Медвежьегорск могут отменить и по другим (непогодным) причинам, как часто бывает у МТФ.
---------- Добавлено ----------
Если половинки, то их еще как-то можно сравнивать.
Если полные маршруты, то тут важнее отределиться, что интересует в первую очередь: СЗ (Карамзин, 12 дней) или Юг (Суворов, 18 дней). Длительность опять же разная.